Predicción del SARS-CoV-2 infeccioso a partir de muestras de diagnóstico

Abstracto

Fondo

La RT-PCR se ha convertido en el método principal para diagnosticar enfermedades virales, incluido el SARS-CoV-2. La RT-PCR detecta ARN, no virus infecciosos, por lo que su capacidad para determinar la duración de la infectividad de los pacientes es limitada. La infectividad es un determinante crítico a la hora de informar las directrices/intervenciones de salud pública. Nuestro objetivo era determinar la relación entre los valores del umbral del ciclo de RT-PCR (Ct) del gen E del SARS-CoV-2 de muestras respiratorias, el inicio de los síntomas hasta la prueba (STT) y la infectividad en cultivos celulares.

Métodos

En este estudio transversal retrospectivo, tomamos muestras positivas confirmadas por RT-PCR del SARS-CoV-2 y determinamos su capacidad para infectar líneas celulares Vero.

Resultados

Se incubaron noventa muestras positivas de RT-PCR SARS-CoV-2 en células Vero. Veintiséis muestras (28,9%) demostraron crecimiento viral. La mediana de TCID50/ml fue 1780 (282-8511). No hubo crecimiento en muestras con un Ct > 24 o STT > 8 días. La regresión logística multivariada utilizando cultivo viral positivo como variable predictiva binaria, STT y Ct demostró un odds ratio para cultivo viral positivo de 0,64 (IC 95% 0,49-0,84, p<0,001) por cada aumento de una unidad en Ct. El área bajo la curva de características operativas del receptor para Ct versus cultivo positivo fue OR 0,91 (IC del 95%: 0,85-0,97, p<0,001), con una especificidad del 97% obtenida con un Ct de >24.

Conclusiones

La infectividad de las células Vero del SARS-CoV-2 solo se observó para RT-PCR Ct <24 y STT <8 días. La infectividad de los pacientes con Ct >24 y duración de los síntomas >8 días puede ser baja. Esta información puede informar las políticas de salud pública y guiar las decisiones clínicas, de control de infecciones y de salud ocupacional. Se necesitan más estudios de mayor tamaño.

Palabras clave: SARS-COV-2, COVID-19, RT-PCR, infectividad, salud pública

Fuente:

Bullard J, Dust K, Funk D, Strong JE, Alexander D, Garnett L, Boodman C, Bello A, Hedley A, Schiffman Z, Doan K, Bastien N, Li Y, Van Caeseele PG, Poliquin G. Predicting Infectious Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 From Diagnostic Samples. Clin Infect Dis. 2020 Dec 17;71(10):2663-2666. doi: 10.1093/cid/ciaa638. PMID: 32442256; PMCID: PMC7314198.