Las vacunas y los factores genéticos del huésped pueden influir en la evolución del SARS-CoV-2 y la aparición de nuevas variantes

Las vacunas y los factores genéticos del huésped pueden influir en la evolución del SARS-CoV-2 y la aparición de nuevas variantes. Incluso los casos vacunados se ven afectados a medida que el virus continúa evolucionando, lo que genera inquietudes sobre la eficacia de las vacunas y la aparición de variantes de escape inmunitario. Aquí, hemos analizado 2295 secuencias de genoma completo de SARS-CoV-2 recolectadas de casos vacunados y no vacunados para evaluar el impacto de las vacunas en la diversidad del virus dentro de los huéspedes. Nuestro análisis comparativo reveló una incidencia significativamente mayor de variantes de un solo nucleótido intrahuésped (iSNV) en los casos vacunados en comparación con los no vacunados (valor p <0,0001). Además, hemos encontrado que procesos mutacionales específicos, incluyendo mutaciones mediadas por APOBEC (C > T) y ADAR1 (A > G), se encontraron más prevalentes en los casos vacunados. Los casos vacunados exhibieron una mayor acumulación de mutaciones no sinónimas que los casos no vacunados. Los iSNV fijos se localizaron predominantemente en los genes ORF1ab y spike. Se identificaron varias variantes clave de escape inmunitario, como S477N, Q493R, Q498R, Y505H, L452R y N501Y, en el dominio RBD del gen spike en casos vacunados. Nuestros hallazgos sugieren que la vacuna desempeña un papel importante en la evolución del genoma viral. El genoma viral adquiere mutaciones aleatorias debido a la replicación propensa a errores del virus, la modificación del hospedador mediante el mecanismo de edición mediado por APOBEC y ADAR1, y el estrés oxidativo. Estas mutaciones se fijan en la población viral debido a la presión selectiva impuesta por la vacunación.