Predicción del síndrome respiratorio agudo severo infeccioso por coronavirus 2 a partir de muestras de diagnóstico

Antecedentes: La reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa (RT-PCR) se ha convertido en el método principal para diagnosticar enfermedades virales, incluyendo el síndrome respiratorio agudo severo por coronavirus 2 (SARS-CoV-2). La RT-PCR detecta ARN, no virus infecciosos; por lo tanto, su capacidad para determinar la duración de la infectividad de los pacientes es limitada. La infectividad es un factor determinante en la elaboración de directrices e intervenciones de salud pública. Nuestro objetivo fue determinar la relación entre los valores umbral del ciclo (Ct) de la RT-PCR del SARS-CoV-2 del gen E en muestras respiratorias, el tiempo de inicio de los síntomas hasta la prueba (STT) y la infectividad en cultivos celulares.

Métodos: En este estudio transversal retrospectivo, tomamos muestras positivas confirmadas mediante RT-PCR de SARS-CoV-2 y determinamos su capacidad para infectar líneas de células Vero.

Resultados: Noventa muestras positivas para SARS-CoV-2 mediante RT-PCR se incubaron en células Vero. Veintiséis muestras (28,9%) mostraron crecimiento viral. La mediana de la dosis infecciosa/ml en cultivo tisular fue de 1780 (rango intercuartil: 282-8511). No se observó crecimiento en muestras con un Ct > 24 o un STT > 8 días. La regresión logística multivariante, utilizando el cultivo viral positivo como variable predictora binaria, el STT y el Ct, mostró una razón de probabilidades (OR) para el cultivo viral positivo de 0,64 (intervalo de confianza [IC] del 95%: 0,49-0,84; p < 0,001) por cada aumento de 1 unidad en el Ct. El área bajo la curva ROC para el Ct frente al cultivo positivo fue de OR de 0,91 (IC del 95%: 0,85-0,97; p < 0,001), con una especificidad del 97% obtenida con un Ct > 24.

Conclusiones: La infectividad de las células Vero del SARS-CoV-2 solo se observó para RT-PCR con un Ct < 24 y un STT < 8 días. La infectividad de los pacientes con un Ct > 24 y una duración de los síntomas > 8 días podría ser baja. Esta información puede fundamentar las políticas de salud pública y orientar las decisiones clínicas, de control de infecciones y de salud ocupacional. Se necesitan estudios adicionales de mayor envergadura.

Fuente

Bullard J, Dust K, Funk D, Strong JE, Alexander D, Garnett L, Boodman C, Bello A, Hedley A, Schiffman Z, Doan K, Bastien N, Li Y, Van Caeseele PG, Poliquin G. Predicting Infectious Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 From Diagnostic Samples. Clin Infect Dis. 2020 Dec 17;71(10):2663-2666. doi: 10.1093/cid/ciaa638. PMID: 32442256; PMCID: PMC7314198.