Abstracto
Antecedentes: Nuestro objetivo fue revisar la evidencia de estudios que relacionan el cultivo del coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo severo (SARS-CoV-2) con los resultados de la reacción en cadena de la polimerasa con transcripción inversa (RT-PCR) y otras variables que pueden influir en la interpretación de la prueba, como el tiempo desde el inicio de los síntomas.
Métodos: Buscamos COVID-19 en LitCovid, medRxiv, Google Scholar y la base de datos de la Organización Mundial de la Salud sobre la enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19) hasta el 10 de septiembre de 2020. Incluimos estudios que intentaron cultivar u observar SARS-CoV-2 en muestras con positividad de RT-PCR. Los estudios se extrajeron de forma dual y los datos se resumieron narrativamente por tipo de muestra. Cuando fue necesario, nos pusimos en contacto con los autores correspondientes de los artículos incluidos para obtener información adicional. Evaluamos la calidad utilizando una herramienta de riesgo de sesgo modificada de Evaluación de la calidad de los estudios de precisión diagnóstica 2 (QUADAS 2).
Resultados: Incluimos 29 estudios que informaron intentos de cultivo u observación de infección tisular por SARS-CoV-2 en esputo, nasofaríngeo u orofaríngeo, orina, heces, sangre y muestras ambientales. La calidad de los estudios fue moderada con falta de informes estandarizados. Los datos sugieren una relación entre el tiempo desde el inicio de los síntomas hasta el momento de la prueba de la muestra, el umbral de ciclo (Ct) y la gravedad de los síntomas. Doce estudios informaron que los valores de Ct fueron significativamente más bajos y las copias logarítmicas más altas en las muestras que produjeron cultivo de virus vivo. Dos estudios informaron que las probabilidades de cultivo de virus vivo se redujeron aproximadamente en un 33% por cada aumento de 1 unidad en Ct. Seis de los 8 estudios informaron ARN detectable durante >14 días, pero el potencial infeccioso disminuyó después del día 8 incluso entre los casos con altas cargas virales en curso. Cuatro estudios informaron cultivo viral de muestras de heces.
Conclusiones: Para la transmisión son necesarios los virus vivos completos, no los fragmentos identificados por PCR. Se deben utilizar pruebas de rutina prospectivas de muestras de referencia y de cultivo y su relación con los síntomas, signos y cofactores del paciente para definir la fiabilidad de la PCR para evaluar el potencial infeccioso. Es poco probable que las personas con un Ct alto tengan potencial infeccioso.
Fuente:
Jefferson T, Spencer EA, Brassey J, Heneghan C. Viral Cultures for Coronavirus Disease 2019 Infectivity Assessment: A Systematic Review. Clin Infect Dis. 2021 Dec 6;73(11):e3884-e3899. doi: 10.1093/cid/ciaa1764. PMID: 33270107; PMCID: PMC7799320.